Negativní barvení
Negativní barvení je nejjednodušší metoda barvení bakterií. Jedná se o způsob barvení nativního preparátu, tedy preparát nesmíme fixovat. Tato metoda využívá toho, že živé buňky barviva nepřijímají, zatímco mrtvé ano. Přidáme-li takové barvivo k nativnímu preparátu, budeme moci pozorovat světlé buňky (živé → neobarvené) na tmavém pozadí.
Požadavky na barvivo
Pro negativní barvení nelze použít každé barvivo. Barvivo musí být netoxické pro bakterie (v opačném případě by zároveň fungovalo jako fixační činidlo a fixované buňky by začaly přijímat barvivo) a dostatečně kontrastní. Nejjednodušším řešením je použití zředěné tuše (1:1), použít lze i 10% roztok nigrosinu.
Vlastní barvení
Vlastní barvení je velice jednoduché. Na podložní sklo naneseme kapku barviva, ve které vytvoříme suspenzi bakterií. Zároveň připravíme roztěr bakterií v barvivu a necháme volně zaschnout. Zaschlý preparát pozorujeme.